Ahora que lo mencionas Mono, creo que en pelis si siempre fue malo, pero recuerdo que en mi mas tierna infancia, llegue a ver una caricatura donde Godzilla era bueno y libraba a Tokio de los malos.
Tenia una amiguita llamada Godzuki (o algo asi) y ella lo llamaba cuando habian problemas en su ciudad y Godzilla salia del mar a patear culos.

Sobre quien gano entre King Kong y Godzilla...
Hay una leyenda urbana que dice que hubo dos finales transmitidos dependiendo la region. Para la version americana, al final ganaba King Kong, pero para la version asiatica Godzilla ganaba.

Aun cuando lo anterior lo han desmentido, yo no la he visto por lo que no te sabria decir quien gana, lo unico que se es que el final es ambiguo.